Conferencia en conmemoración de los 15 años de la Red SciELO - Scientific Electronic Library Online

Conferencia: www.scielo15.org

SciELO - Scientific Electronic Library Online (Biblioteca Científica Electrónica en Línea) es un modelo para la publicación electrónica cooperativa de revistas científicas en Internet, especialmente desarrollado para responder a las necesidades de la comunicación científica en los países en desarrollo y particularmente de América Latina y el Caribe. El modelo proporciona una solución eficiente para asegurar la visibilidad y el acceso universal a su literatura científica, contribuyendo para la superación del fenómeno conocido como 'ciencia perdida'. Además, el Modelo SciELO contiene procedimientos integrados para la medida del uso y del impacto de las revistas científicas.

La conferencia de conmemoración de los 15 años de la Red SciELO reunirá autoridades y especialistas de investigación y comunicación científica. El objetivo del encuentro es destacar y debatir el estado del arte de la comunicación científica en acceso abierto y los desafíos para el desarrollo de los periódicos científicos y del Programa SciELO

El programa de la conferencia comprenderá las siguientes sesiones:

• Políticas de Investigación y Comunicación Científica

Avances en las políticas nacionales de investigación y comunicación científica de los países emergentes y en desarrollo con énfasis en el fortalecimiento de sus capacidades e infraestructuras nacionales y de la inserción de las investigaciones en el flujo global de información científica, con destaque en el papel de los periódicos nacionales y regionales.

• Acceso Abierto – Estado actual y tendencias

El estado actual y las perspectivas del movimiento y modus operandi de la publicación de periódicos en acceso abierto con destaque en los modelos de financiamiento, ampliación de la indización y el aumento del impacto.

• Cienciometría – Medida de Calidad de las Investigaciones y de los Periódicos

Aplicación de las metodologías e instrumentos de la cienciometría en la evaluación de la calidad e impacto de la investigación publicada con destaque en las especificidades de los periódicos nacionales de las diferentes áreas del conocimiento y del uso de idiomas diferentes del inglés.

• Tendencias e Innovaciones en la Comunicación Científica

Principales tendencias e innovaciones en la comunicación científica internacional, con énfasis en la aplicación en la indización, edición, publicación y diseminación de los periódicos de los países en desarrollo.

• Experiencias, Soluciones, Productos y Servicios de Comunicación Científica

Presentación, demostraciones y showroom de experiencias, soluciones, productos y servicios de instituciones, redes, editores, empresas nacionales e internacionales, enfocados en el estado del arte en la edición y publicación de periódicos científicos.

Las conferencias contarán con traducción simultánea para Portugués, Inglés y Español. El evento incluirá también cursos y encuentros sobre comunicación científica.

Inscripciones: http://www.bireme.br/bvs/reuniao/E/public.htm

Sobre la Red SciELO consulte: http://www.scielo.org/php/index.php

Sobre SciELO Uruguay consulte: http://www.scielo.edu.uy/scielo.php

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Publicaciones sobre Temas de Interés

Computational approaches to identify functional genetic variants in cancer genomes

Fuente: Nature Methods, 10: 723–729 (2013)

Abel Gonzalez-Perez, Ville Mustonen, Boris Reva, Graham R S Ritchie, Pau Creixell, Rachel Karchin, Miguel Vazquez, J Lynn Fink, Karin S Kassahn, John V Pearson, Gary D Bader, Paul C Boutros, Lakshmi Muthuswamy, B F Francis Ouellette, Jüri Reimand, Rune Linding, Tatsuhiro Shibata, Alfonso Valencia,Adam Butler, Serge Dronov, Paul Flicek, Nick B Shannon, Hannah Carter, Li Ding, Chris Sander, Josh M Stuart, Lincoln D Stein & Nuria Lopez-Bigas for the International Cancer Genome Consortium Mutation Pathways and Consequences Subgroup of the Bioinformatics Analyses Working Group

Abstract

The International Cancer Genome Consortium (ICGC) aims to catalog genomic abnormalities in tumors from 50 different cancer types. Genome sequencing reveals hundreds to thousands of somatic mutations in each tumor but only a minority of these drive tumor progression. We present the result of discussions within the ICGC on how to address the challenge of identifying mutations that contribute to oncogenesis, tumor maintenance or response to therapy, and recommend computational techniques to annotate somatic variants and predict their impact on cancer phenotype.

Subject terms: Cancer genomics, Computational biology and bioinformatics, Sequence annotation, Genetic variation

Nota: Para solicitar el artículo completo dirigirse al CDIC
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The Cancer Genome Atlas (TCGA) Data Consumption by the Scientific Community

LEADERSHIP UPDATE

Posted: June 28, 2013

Fuente: http://cancergenome.nih.gov/researchhighlights/leadershipupdate/ZhangTCGAStats

Since the inception of The Cancer Genome Atlas (TCGA) in 2006, almost 6,000 cases (with a case defined as tumor and a source of germline) have been characterized, representing more than 25 different tumor types. Extensive DNA/RNA/miRNA sequencing, expression, methylation, SNP and copy number data have been provided to the public via the TCGA Data Portal and the Cancer Genomics Hub (CGHub). In addition to generating the core datasets, the TCGA Research Network has published comprehensive tumor-specific marker papers that describe global analyses of the data, novel discoveries and clinical insights. The generation of comprehensive, high-quality cancer genomics data and initial integrative analysis of the data are important goals of TCGA. However, the data and reports are intended to be only starting points, and the participation of the broader research community in analyzing the datasets is necessary to realize their full value.

Therefore we examined three metrics of TCGA data usage to determine whether the scientific community has been consuming and analyzing TCGA data: (1) usage of the TCGA Data Portal and Cancer Genomics Hub, (2) grant applications that cite TCGA data in the research objectives and (3) publications that incorporate TCGA data.

Usage of the TCGA Data Portal

Figure 1. Number of unique visitors to the TCGA Data Portal from 2011-2012. Courtesy of NCI CBIIT.

Figure 1 shows the number of unique visitors to the TCGA Data Portal from 2011 to 2012*. In just two years, the number of unique visitors more than doubled from 3,386 to 8,267 between January 2011 and December 2012. This shows that more and more users are seeking TCGA data.

*Earlier usage statistics were unavilable.

Usage of the Cancer Genomics Hub

The Cancer Genomics Hub (CGHub) was established in late 2011 as a repository for the secure storage, cataloging and dissemination of large-scale primary sequence data for TCGA and other projects. As of December 2012, over 150 users have downloaded almost 4,400 terabytes of data. The top users come from a variety of institutions (universities, research centers, pharmaceutical companies, etc.) and from many different countries.

Grant Applications

Figure 2. The number of grant applications that cite TCGA data submitted to the NIH each year from 2006-2012

Figure 2 shows the number of new grant applications submitted to the NIH that cite TCGA data in the research objectives. The sum of applications has increased from 46 applications submitted in 2006 (at the beginning of TCGA’s pilot project) to 215 applications submitted in 2012. This shows that more and more researchers are incorporating TCGA data in their projects and are seeking funding to analyze TCGA data. As of December 2012, almost 800 unique applications citing the use of TCGA data have been submitted.

Of the 800 grant applications submitted, 278 were awarded. This is an award rate of almost 35 percent. The award rate for all applications submitted to the National Cancer Institute is on average 15 percent.

Publications

Figure 3. The number of articles that analyzed TCGA data published each year from 2008-2012

Figure 3 shows the number of papers published that analyzed TCGA data has increased dramatically from three papers in 2008 to 157 papers in 2012. At the end of 2012, more than 265 papers were published in total. By May 2013, more than 350 papers have been published in total.

There has been wide speculation that almost all papers that analyze TCGA data are authored by members of the TCGA Research Network, however the opposite is true. Most of these papers (65 percent) were authored by non-TCGA consortium scientists, dispelling the misconception that TCGA data are only accessible to “insiders.”

TCGA’s first marker paper,

The Cancer Genome Atlas Research Network. (2008) Comprehensive genomic characterization defines human glioblastoma genes and core pathways. Nature. 455 (7216):1061-1068.

remains in the top 10 of the most cited cancer research papers since 2008 (based on an analysis from the Scopus database).

Conclusions

Together, these observations suggest that TCGA is on its way to meeting goals of creating an atlas that is broadly used by the cancer research community. However, we have a long way yet to go as TCGA works to complete this phase of the catalog by the end of 2014. We continue to challenge the community to utilize the data to develop new algorithms, form new hypotheses, initiate molecularly-informed clinical trials and make discoveries that will inform how we will better diagnose, treat and prevent cancer in the future.

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Novedades: Global Map of Smokefree Laws – 2013

Fuente: http://www.globalsmokefreepartnership.org/

El Mapa Global de Leyes de Ambientes Libres de Humo da una visión general del “estado libre de humo” de la mayoría de países del mundo. Para cada país todos o algunos de los siguientes datos se incluyen:

• Una visión general de la legislación de ambientes libres de humo y las iniciativas de ambientes libres de humo, en particular, los planes para la aplicación del artículo 8
  
• Recursos de ambientes libres de humo disponibles en 2013 - grupos de control del tabaco, la ayuda de organizaciones no gubernamentales, sitios web
  
• Ejemplos de materiales de educación pública / ejecución o materiales de aplicación
  
• Cualquier necesidad relacionada con la aplicación de las políticas libres de humo
  
• Los factores que ayudan o dificultan la aplicación del artículo 8
  
• Otros países que han influido en las leyes libres de humo

La información fue suministrada por los contactos de todo el mundo en respuesta a los cuestionarios enviados por correo electrónico, por los responsables de dicho sitio web. La mayoría de los encuestados enviaron ejemplos de recursos libres de humo, que van desde materiales de la campaña a las copias de la legislación.

Puede realizar la consulta del Mapa Global y especificaciones en:

http://www.globalsmokefreepartnership.org/global-map-of-smokefree-laws-2013/

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Eventos Internacionales, Regionales y Nacionales destacados en ésta Edición

2013 Breast Cancer Symposium: Multidisciplinary Perspectives on Clinical Management

7- 9 de Setiembre de 2013. San Francisco, CA, USA

El Simposio de Cáncer de Mama 2013 es un encuentro multidisciplinario centrado exclusivamente en el cáncer de mama que reúne a médicos oncólogos, radio-oncólogos y cirujanos para descubrir y debatir las últimas investigaciones, con el objetivo de fortalecer los métodos de tratamiento de colaboración y mejorar la atención al paciente. El Simposio facilita discusiones interactivas sobre las últimas estrategias de tratamiento para lograr resultados óptimos.

Sitio web: http://breastcasym.org/

Clinical Practice & Implementation of Image-Guided Stereotactic Body Radiotherapy

8 -12 de Setiembre de 2013. Lille, France

El curso está dirigido a todos los profesionales en el campo de la oncología de radiación, que están involucrados en la práctica clínica de SRS y SBRT craneal en cualquier punto de la cadena de tratamiento: oncólogos, físicos y tecnólogos en radiación con un enfoque dedicado a SBRT y SRS. Tiene como objetivo general conocer los antecedentes históricos y el desarrollo de la radiocirugía craneal (SRS) y radioterapia corporal estereotáctica (SBRT) así como ofrecer una visión general de la planificación del tratamiento disponibles y tecnologías de entrega y la forma de integrarlos en la práctica clínica de la SBRT

Sitio web: http://www.estro.org/school/items/clinical-practice--implementation-of-image-guided-stereotactic-body-radiotherapy

IMAGE-GUIDED RADIOTHERAPY AND CHEMOTHERAPY IN GYNAECOLOGICAL MALIGNANCIES - Focus on adaptive brachytherapy .

8- 12 de Setiembre de 2013. Barcelona, España

El curso está dirigido a oncólogos médicos y radioterapeutas, ginecológicos, físicos médicos y tecnólogos radiológicos involucrados en los tratamientos de tumores ginecológicos, interesados en la aplicación de conceptos y técnicas avanzadas. Proporcionará una visión global de todo el campo de la ginecología Radioterapica enfoque de irradiación externa y braquiterapia en el cáncer de cuello uterino, cáncer endometrial y cáncer de la vagina.

Sitio web: http://estro-education.org/courses/Pages/Barcelona2013.aspx

Multidisciplinary Cancer Management Course (ASCO)

12 al 14 de Setiembre de 2013. Hotel Sheraton, Montevideo, Uruguay

Poster:

El Multidisciplinary Cancer Management Course (MCMC) es organizado por el Servicio de Oncología Clínica del Hospital de Clínicas (SOC), la Federación Latinoamericana de Sociedades de Cancerología (FLASCA), y la American Society of Clinical Oncology (ASCO). El programa científico abordará la siguiente temática: manejo del cáncer de mama precoz, cáncer colorrectal, cáncer de pulmón. Contará con prestigiosos invitados extranjeros especialistas en las diferentes áreas.

Inscripciones: Secretaría Administrativa Atenea Eventos Srl. en:

Sitio Web: http://www.atenea.com.uy/

2nd World Congress of Clinical Safety

12-13 de Setiembre de 2013. Heidelberg, DE

El Congreso está organizado por IARMM en el marco de la cooperación con la Universidad de Heidelberg y otras organizaciones alemanas. Su objetivo es mejorar y promover la ciencia y la tecnología para mejorar la seguridad, tanto en gestión de riesgos y crisis en la atención de la salud. El congreso incluye una amplia gama de temas tales como la seguridad de los pacientes, la seguridad de medicamentos, la seguridad de dispositivos médicos, los brotes de enfermedades infecciosas, y temas relacionados.

Sitio web: http://www.iarmm.org/2WCCS/

VI CONGRESO URUGUAYO DE ANATOMÍA PATOLÓGICA y IV JORNADAS DE ANATOMÍA PATOLÓGICA DEL MERCOSUR

18-20 de setiembre de 2013. Colonia, Uruguay

El VI Congreso Uruguayo de Anatomía Patológica tendrá lugar en el Centro Cultura Bastión del Carmen – Colonia del Sacramento. La temática a abordar será: Patología pulmonar, Patología de partes blandas, hematopatología, uropatología, patología hepática, patología ginecológica

Sitio web: http://www.medicinainterna.org.uy/images/stories/cursos/anatomia-patologica2103.pdf

NCCN 8th Annual Congress: Hematologic Malignancies

20 – 21 de septiembre de 2013. New York Marriott Marquis, New York, USA

El tratamiento de las neoplasias malignas hematológicas es cada vez más complejo. Los nuevos lineamientos relacionados con la patología, el trasplante, y las nuevas terapias requieren que oncólogos y hematólogos se mantengan al corriente de los avances innovadores. Este congreso se centra en los nuevos enfoques que se han incorporado en el manejo del paciente, incluyendo el uso de las drogas, productos biológicos y diagnósticos.

Sitio web: http://www.nccn.org/professionals/meetings/hematological/default.asp

SIOP 2013 - 45th Congress of the International Society of Paediatric Oncology

25 – 28 de Setiembre de 2013. Hong Kong, China

SIOP 2013 es la mayor reunión anual de cáncer pediátrico en el mundo, que atrae a una asistencia multilateral conectando padres, sobrevivientes, médicos, profesionales sanitarios, investigadores y empresas. El programa científico consiste en sesiones educativas, que incluyen: simposios multi-disciplinarios, conferencias magistrales, sesiones de carteles , debates interactivos sobre los descubrimientos más recientes y el tratamiento de todos los tipos de cáncer que afectan a los niños, incluyendo leucemia y los tumores cerebrales.

Sitio web: http://www2.kenes.com/siop/pages/home.aspx

XI Congreso Internacional de Mastología de la Sociedad Boliviana de Mastología

26 – 28 de setiembre de 2013. Cochabamba, Bolivia

Afiche:

17th ECCO - 38th ESMO - 32nd ESTRO European Cancer Congress

27 de setiembre al 01 de octubre de 2013. Amsterdam, NL

La 17 ª ECCO - ESMO 38 º - 32 º ESTRO Congreso Europeo del Cáncer combinará esfuerzos conjuntos de las organizaciones asociadas para continuar con la multidisciplinariedad, como el camino a seguir para mejorar la prevención, diagnóstico, tratamiento y el cuidado de los pacientes con cáncer, fomentando la participación y la interacción entre todos los profesionales de la oncología, con independencia de su enfoque.

Sitio web: http://eccamsterdam2013.ecco-org.eu/

V Jornadas del Servicio de Oncología Radioterápica. Facultad de Medicina, Hospital de Clínicas

15 y 16 de Noviembre de 2013. RADISSON Resort & Casino. Colonia. Uruguay

Avance:

Las Jornadas de Oncología Radioterápica se realizan desde hace 10 años, con frecuencia cada dos años, intercaladas con el Congreso Uruguayo de Oncología.

Tienen como objetivo, el diseñar la implementación de soluciones para resolver problemas específicos que presentan los pacientes oncológicos en la actividad diaria, en principio bajo el formato de talleres que funcionarán simultáneamente. En dichos talleres participarán especialistas oncólogos médicos, ginecólogos, otorrinolaringólogos, imagenólogos, cirujanos, neurocirujanos, urólogos, oncólogos radioterapeutas, residentes, postgrados, técnólogos y físicos médicos. Cada taller tendrá un producto final que consistirá en realizar un procedimiento documentado que pretenda dar solución a los problemas planteados en el taller.

Los temas a tratar serán los siguientes (Programa preliminar):

• ORL: Tratamiento Laríngeo (cirugía, radioterapia y quimioterapia).
• SNC: Impacto Genético y molecular en neuro-oncología – Papel del PET.
• HEMATO-ONCOLOGÍA: Radioterapia en el Tratamiento de los linfomas/ TBI (Irradiación Corporal Total).
• DIGESTIVO: Tratamiento conservador en Cáncer de Recto.
• GINECOLOGÍA: Rescate quirúrgico en Cáncer de Cuello uterino avanzado tratado con Radioquimioterapia.
• URO-ONCOLOGÍA:
• Control de la Calidad en Radioterapia.
  

Inscripciones

Las inscripciones se realizarán en la Cátedra de Oncología Radioterápica de 8.30 a 12.00 horas de lunes a viernes en Secretaría: Sra. Claudia Cazarré, al teléfono: 24873013, o vía mail a: radioterapiahc@gmail.com

Por mayor información sobre eventos nacionales, regionales e internacionales consulte el Directorio de Eventos - DIREVE de la BVS-Oncología:

http://www.bvsoncologia.org.uy

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